El CIEE abrió sus puertas el 3 de octubre del 1994 gracias a la iniciativa del Sr. Manuel Fernández, padre de un joven con discapacidad quien, junto a otros padres   en igual condiciones buscaban desesperado un espacio donde sus hijos pudieran desarrollar al máximo sus potencialidades en un clima de respeto, tolerancia y pluralismo.

En  sus inicios el CIEE acogió en sus programas a niños adolescentes y jóvenes con discapacidad intelectual y autismo. Fue cinco años  mas tarde  en el 1999 en el que diseño programas para  atender a un grupo de niños con parálisis cerebral cuyo centro de procedencia había cerrado su programa. Esa decisión nos obligó a ampliar los recursos humanos incorporando a nuestro equipo interdisciplinario medico fisiatra y fisioterapeuta.

En el CIEE la educación especial es concebida como el subsistema de educación, cuyo objeto primordial, es promover de forma intencional el desarrollo de capacidades y competencias, que le permitan a los alumnos ser miembros activos en su marco sociocultural de referencia, mediante la oferta de una propuesta educativa comprensiva y diversificada que evite la discriminación y desigualdad de oportunidades, mientras respeta las características y necesidades individuales.